元辰殿位於元辰殿大樓三樓，1998年10月開幕。殿內供奉斗姥元君，及六十甲子太歲。道教認為斗姥元君是統轄星宿的尊神，而太歲神都是由歲星所演化的星君，故斗姥及太歲通常都會出現在同一殿宇中。
斗姥元君是眾星之母，太歲亦與星辰有關（太歲的「歲」即歲星，是古時木星的稱呼）。道教會根據各個殿內供奉的神明作相應裝潢，斗姥與太歲均屬於星宮斗府，故本館因應中國古代天文觀，將元辰殿布置成星界。為此，元辰殿殿頂就以四靈二十八宿為裝飾。
今天我們熟悉西方天文學講的十二星座，而同一位置的星辰，在中國傳統星學中則分為二十八宿。「宿」是停留的意思，所謂二十八宿是太陽和月亮在星空上停留的二十八個位置。這二十八個位置分為東方蒼龍、北方玄武、西方白虎、南方朱雀四組，稱作「四象」或「四靈」。而傳統上以北斗斗柄所指的角宿起始，依次為角、亢、氐、房、心、尾、箕、斗、牛、女、虛、危、室、壁、奎、婁、胃、昴、畢、觜、參、井、鬼、柳、星、張、翼、軫。
斗姥元君，簡稱斗姥或斗姆。根據明代《正統道藏》所收錄的《太上玄靈斗姆大聖元君本命延生心經》記載，斗姥尊號為「九靈太妙白玉龜臺夜光金精祖母元君」，又有「中天梵炁斗母元君紫光明哲慈惠太素元后金真聖德天尊」等尊號。據此經所載，斗姥曾發下至願生下聖子，以補裨造化，統制乾坤。一天，斗姥沐浴於九曲華池，池中湧出「白玉龜臺神獬寶座」。斗姥遂登上寶座怡養神真，修鍊精魄，沖然攝炁。當修鍊至果證玄靈妙道之際，無極微妙光明洞徹華池，化生金蓮九苞。後經歷人間七晝夜的時間，華池光明愈熾愈盛，上騰九華天中，最終化成北斗九皇，即天皇、紫微、貪狼、巨門、祿存、文曲、廉貞、武曲、破軍。因此斗姥亦為北斗眾星之母。
本館斗姥元君聖像形相莊嚴，具四面八臂，結跏趺（即類似盤膝）坐於蓮花白玉寶座之上。斗姥四面之相各有不同，有慈祥、憤怒、莊嚴及猙獰的面容。斗姥最上一雙手高舉日、月，代表統轄眾星；第二雙手持帝鐘及金磚兩種法器；第三雙手執弓箭及戟；第四雙手則結手印。
古代以干支紀年，由甲子到癸亥為一週，共計六十年，每年皆有一位太歲值年，即六十太歲，管理當年人間禍福。而「本命太歲」則主管人一生的吉凶命運。
拜太歲
禮拜太歲祈求福庇，是道教信仰傳統。禮拜「本命太歲」時，亦要禮拜當年的「值年太歲」，以保佑當年事事順利。每年立春後，善信便可向斗姥元君、當年太歲及「本命太歲」上香叩稟，發願行善，祈求當年平安順遂。至年尾冬至前，善信應酬謝斗姥與六十太歲，報答神明保佑之恩。
「攝太歲」，是古時的人在「拜太歲」時，把香油金攝在太歲像下，久而久之形成的習俗。本館每個太歲神下都設有一個收集箱，方便善信「攝太歲」。
